De goedgekeurde programma's betreffen onderzoek in de subatomaire fysica, kernfusie, technische fysica, mathematische fysica, nanotechnologie en, samen met Philips, dunne-filmmaterialen.
De programma's die in ontwikkeling zijn bestrijken zeer uiteenlopende onderwerpen, van onderzoek samen met biologen en onderzoek samen met chemici en bedrijfsonderzoekers aan stoffen als zeep, lijm en vloeibare kristallen tot de ontwikkeling van een detector voor zwaartekrachtgolven. Programma's in ontwikkeling hebben nog geen definitieve goedkeuring van het FOM-bestuur. De opstellers van die programma's werken aan een gedetailleerde uitwerking, die nog beoordeeld zal worden door buitenlandse deskundigen.
