De organisatie beriep zich op het calamiteitenplan en verzocht alle deelnemers die op weg waren, terug te keren naar het sportcentrum in Nijmegen. Sommigen waren de spoorwegovergang al gepasseerd, anderen werden voor dat punt tegengehouden door politie, brandweer en organisatoren. Intussen bekeek de wedstrijdleiding of een alternatieve route de geblokkeerde kruising zou kunnen omzeilen. Maar op hetzelfde moment meldde de politie dat de race hervat kon worden: de spoorwegovergang werd vrijgegeven.
De opgelopen vertraging was door het ongeval aanzienlijk. Om tijd te winnen, werd besloten om bij het opnieuw starten van de race etappe 1 helemaal te laten vervallen. De gelopen tijden van vóór het stilleggen van de race werden geneutraliseerd. Ze werden voor zover bekend gewoon gepubliceerd, maar telden niet mee voor het klassement. Daarnaast beperkte de wedstrijdleiding de vertraging door lopers bij de herstart in Dinxperlo en Barchem sneller achter elkaar te laten starten. Uiteindelijk vertrokken de ploegen drie kwartier later dan gepland vanaf de Oude Markt in Enschede. De Batavierenrace werd in het jaar 2000 ook een keer stilgelegd, toen was in verband met zwaar onwaar een aantal etappes te onveilig. Na dat incident werd het calamiteitenplan volgens de organisatie flink verbeterd.
